Amerikan modasının etkisi altındaki bir Japon sanayicisi, bireysel atom barınakları inşa etmeye karar verdi, ancak seri üretim kuramadılar ve inşa edilen tek barınak terk edildi. Beş yıl sonra, sığınakları vakıf olarak kullanan inşaat şirketi, arkası eğime bitişik olan üç katlı bir bina inşa etti. Bu evde toplumu gönüllü olarak terk eden bir adam yerleşti. Yakın geçmişte, ünlü bir politikacının kişisel sekreteriydi, kızıyla evlendi ve kayınpederinin kontrol ettiği bir inşaat şirketinde atom barınaklarının reklamını yaptı.

Ancak iyi bir gün, karısından doktorların zihinsel engelli olduğunu düşündüğü beş yaşındaki bir çocuğu aldı ve bir barınakta münzevi olarak çocukla yaşamaya başladı. Kendisini bu dünyada en çok sevdiği kişilerin - ağaçlar ve balinalar - avukatını atadı. Yeni özünü vurgulamak için adını değiştirdi ve kendine Ooki ("güçlü ağaç") Isana ("cesur balık") demeye başladı. Dışarıda büyüyen ağaçlar için dürbün izleyerek balinaların fotoğraflarına bakmakla meşgul. Doğaya daha yakın olmak için, sığınağın tabanında 30 × 30 santimetre bir delik açtı ve çıplak ayaklarını gerçek dünyaya koyarak düşünmeye başladı. Isana çeşitli kuşların seslerini bantladı ve oğlu Dzin onları doğru bir şekilde tanımayı öğrendi: çocuğun olağandışı keskin bir duruşmaya sahip olduğu ortaya çıktı.

Bir barınak penceresinden görülebilen bataklık bir ovada bir olay meydana geldiğinde. Genç bir kız bir polis ajanını baştan çıkarır ve arkadaşları ona saldırır ve silahı alır. Kendini kurtarmak için ajan, saldırganların en zayıflığını seçer ve elindeki ikinci kelepçeyi tıklatırken, eline bir kelepçe koyar. Gençler ajanı dövdü ve çocuk kaçmak için elini kesmeye çalıştı. Bir polis ajanı kelepçeyi açar ve kaçar ve gençler uzun bir süre onun arkasından çığlık atar.

Ağaçların genç yapraklarla kaplı olduğunu ve tam bir güvenlik hissi kazandığını gören Isana, ruhsal olarak onlarla bağlantılı, korunmuş hisseder ve barınaktan ayrılır. Bitkiler gibi, kış uykusundan uyanır ve içinde biriken enerji için bir çıkış yolu arar. Jin ile birlikte otobüse biniyor ve parka gidiyor, ama çok geç geliyorlar: park zaten kapalı ve geziler çalışmıyor. Bekçi yine de onları özlüyor ve ıssız bir parkta, biri bandajlı bir eli olan bir grup agresif gençle tanışıyorlar. Isana sorumsuz bir korku hissediyor ve barınağa dönmek için acele ediyor. Mağazaya gidip Jin'i evde yalnız bırakan Isana da korku yaşar. Geceleri kabus görüyor. Barınaklarının her zaman izlendiğini hissediyor. Bir kez bir evin duvarındaki bir çizimi keşfeder - bir daire ve bir haç. Isana bu göz modelinin yanında boyar. Evinin yanında, ünlü aktrisin soyunma odasında, bataklık ovalarından uzakta duran, terk edilmiş bir film stüdyosunda uyumasını teklif eden bir kızla tanışır. Isana hiçbir şeye cevap vermez ve ayrılır ve geceleri gençlerin çatıda ezildiğini duyar ve kırılgan zihinsel dengesi çok kolay olan Jin hakkında endişelenir.

Ertesi gün, Isana bir film stüdyosunun kalıntılarında dürbünle bakar ve köşkün penceresinde çıplak bir kız görür. Aniden onu gözetlemekle suçlayan bir grup genci fark eder. Isana ve Jin'in neden kimseyle konuşmadan burada yaşadıklarını soruyorlar. Isana onlara ağaç ve balina avukatı olduğunu açıklar. Yeniden misilleme tehdidinde bulunan gençler, Isan'ı, yaraları iltihaplamaya başlayan bir genci Boy'a evine ve Isan'ın onunla yatmasını öneren kız olan Inago'ya izin vermeye zorladı. Inago Jin'e bakarken Isana, hasta için ilaç için eczaneye gider. İsan'ın sürprizine göre, kız bebeği dikkatli ve dikkatli bir şekilde tedavi eder.

Gençlerden biri olan Takaki, Isana'ya Balina Ağacı hakkında bilgi verir. Çocukken Takaki onu duydu, hayal etti, ama hiç görmedi. "Balina Ağacı" adı Isan'a sıcak bir his veriyor, aynı zamanda böyle bir ağacın var olduğu da görülüyor. Eczaneden dönen Isana bisikletten düşüyor. Gençler gülüyor, yaralanabileceğini hiç düşünmüyor. Isana zulümlerine hayret eder. Takaki, çalıntı bir arabaya Isana'ya gelir ve Balina Ağacı'nın hikayesini devam ettirir. Birkaç gün sonra Takaki, Isana'ya gençler için bir önbellek gösterir: terk edilmiş bir film stüdyosuna yerleştiler. Birinin koruyacağı düşünülen gemiyi söktüler, bir kısmını pavyonlardan birine sürüklediler ve orada topladılar ve denizcilik işlerini incelemeye başladılar, böylece daha sonra yelken açabildiler. Gençler Serbest Denizciler Birliği'nde birleşiyor ve bodrumdaki kabinleri donatıyorlar.

Takaki'nin neredeyse iyileşip gemiye geri dönen Savaş Isan'ı getirdiğini görmek, "bu çılgın adamı" vurmak istemektedir: Kimse önbelleklerini bilmemelidir. Isana ölümden korkmaz: Inago, çocuğa o kadar iyi bakar ki, babası olmadan yapabilir. Ancak Isana görevini yerine getirmek zorundadır - diğer dünyalardan gelen yeni gelenlere yeryüzünde hüküm süren insan değil, balinalar ve ağaçlar olduğunu söylemek. Mücadele, Isana'nın onları polise bildireceğinden korkuyor, ancak diğer tüm gençler Isan'a güvenle güveniyor ve ona katılmalarını teklif ediyorlar.

Zaten kırk yaşında olan ve Isan'dan bile daha yaşlı olan Korotky adında bir adam, otuz beş yaşında aniden küçülmeye ve hala küçülmeye başladığını söylüyor. Gerçekten de, bacakları aşırı kısa bir vücuda kıyasla çok uzun görünüyor. Bir psikiyatri hastanesine yollandı, ama oradan kaçtı. Sıradan insanların dünyasında yeri yoktur ve bir ergen toplumunda normal hisseder. Isan’ın ağaçlar ve balinalar hakkındaki akıl yürütmesini dinleyen gençler, sahip olmadıkları şeylere sahip oldukları sonucuna varırlar: düşüncelerini kelimelere dökebilme yeteneği. Kelimeye mükemmel şekilde hakim olmasının onlar için yararlı olabileceğine inanıyorlar.

Isana gençlerine günahlarını itiraf eder: kayınpederinin sekreteriyken çocukları sapıklıklarını şımarttı. Bir keresinde yanlışlıkla bir çocuğu öldürdüler ve o zamandan beri Isana barışı bilmiyordu. "Kelimelerde uzman" olarak, Isan gençler ile İngilizce öğrenmeye başlar ve İngilizce çevirisinde bu "Moby Dick" ve Dostoyevski'yi seçer. İlk başta, yaşlı Zosima'nın konuşmalarının gençler için çok ahlaki göründüğünden korkuyor, ancak büyük bir ilgi ile dinliyorlar ve “dua” kelimesi tam anlamıyla onları yakalıyor. İsan'ın sürprizine göre, ergenler Jin'e gerçekten aşık oldular ve ciddi müzik dinlemekten zevk aldılar. Isana dünyanın sonunu beklemekte yaşıyor ve gençler Büyük Depremi bekliyor - çok ortak noktaları var.

Gençler, kendini savunma güçlerinin (sevgili Inago) bir askeri tarafından Serbest Denizciler Birliği'ne çekilir. Onlara silahlarla nasıl başa çıkacaklarını öğretmelerini istiyorlar. Isana karısı Naobi'den sahilde ve arkadaşlarının iki ila üç hafta yaşayabilecekleri bir yer bulmalarını ister. Naobi, Izu'da onlar için böyle bir yer bulur, ancak orada Korotky ihanet eder - Serbest Denizciler Birliği'nin askeri tatbikatlarını fotoğraflar ve haftalık olarak fotoğraf satar. Suçun onları birleştireceğine ve Özgür Denizciler Birliği'ni askeri bir organizasyona dönüştüreceğine inanarak gençleri onu öldürmeye zorlamak istiyor. Gençler Korotky'nin yargılanmasını düzenler, bu sırada bunlardan biri - Tamakichi - yanlışlıkla Korotky'ye zarar verir. Kısa yaranın ölümcül olduğunu fark eden ergenler onu infaz etmeye karar verirler. Her biri ona bir taş atar. Isana ve asker birbirlerinden ayrılırlar. Yüklü bir makineli tüfeği alıp Inago'yu fırlatan bir asker, bir motosiklete biner ve kaçar, gençler kovalar. Bunlardan biri - Tamakichi - bir balıkçı gemisine el bombası atıyor. Geminin ışığı yanar ve şüphe askere düşer. Bir asker intihar eder. Inago, sığınan Isan, Isan, Dzini ve Inago'nun metresi olur. Orada gençler tarafından karşılanıyorlar: bir film stüdyosunu yok ediyorlar, gidecek hiçbir yerleri yoktu ve bir pencereyi kırdıktan sonra Isan'ın barınağına tırmandılar.

Film stüdyosundaki pavyonda sadece bir savaş vardı: asla gemiden ayrılmayı kabul etmedi. Böylece yanlış ellere düşmemesi için havaya uçurur. Bir film stüdyosunu yok eden işçiler Boy'u yendi. Tamakichi, ölmekte olan yoldaşını Tokyo Üniversitesi'ndeki bir kliniğe götürür ve onu arcade'de bırakır. Gençler bundan sonra ne yapacağını düşünüyor. Isana Naobi'den geminin gençlerle yelken açması için para almasına yardım etmesini ister. Naobi seçim için kendini aday gösterdi ve Isana, kocası ve oğlunun atomik bir sığınakta oturmak yerine balinaları koruyarak denizde yüzmesinin daha karlı olacağını umuyor. Naobi, inşaat şirketine Isan'dan sığınak ve arazi almasını teklif etmeyi vaat ediyor - gelirler planlanan işletme için yeterli olacak. Her ihtimale karşı, ergenler yiyecek tedarik ediyorlar - eğer kuşatılmaları gerekiyorsa, onlara bir barınakta ihtiyaç duyacaklar, ancak yelken açmaları bekleniyorsa, onları yanlarında götürecekler. Çocuğu tehlikeye atmamak için gençler, Isan ve Jin'e barınaktan ayrılmalarını teklif eder, ancak Isana karısına kendileri ve Jin'in rehin alındığını bildirmek ister - o zaman elbette emrinde bir gemi koyacaktır. Polis arabaları barınak penceresinden görülebilir. Motorlu bir ekip binayı kuşattı. Gençler ateş eder, polis göz yaşartıcı gaz yakar. Kuşatılmış olanı teslim olmaya çağırıyorlar.

Gençler, İsan'ın karısının gelişini bekliyor. Naobi gelir, ancak çocuğunun hayatı adına bile suçlularla anlaşma yapmayacağını iddia eder. Gençler cesurca savaşır, ancak güç yanlarında değildir ve birbiri ardına ölürler. Artık gemiye ihtiyaç duymadıkları anlaşılıyor: navigatör ve radyo operatörü öldürüldüğü için hala yelken açamadılar. Tamakichi sonuna kadar savaşmayı planlıyor, ancak Özgür Denizciler Birliği'nin iz bırakmadan yok olmasını istemiyor. Takaki'yi onu terk etmeye ve canlandırmaya davet ediyor. Serbest Denizciler Birliği'ne göre Isana uzman olarak istifa etti, şimdi bir balina ve ağaç avukatının görevlerine tamamen bağlı. Takaki, Balina Ağacı hakkındaki hikayesinin kurgu olduğunu kabul ediyor, ancak Isana, Takaki’nin evine gidemediği ve buna ikna olamayacağı anda, hiçbir şey Balina ağacının var olduğuna inanmasını engelleyen bir şey olmadığını itiraf ediyor. Beyaz bayraklı Takaki barınağı terk eder, ardından Jin ile kollarında Inago ve bir doktor (tıp enstitüsünde eski bir öğrenci) gelir. Arabaya giderken polis onları dövdü.

Araba teslim olanları götürdüğünde, vinçli bir itfaiye aracı sığınağa gider ve binayı mahvetmeye başlar. Barınakta sadece Isana ve Tamakiti kaldı. Isana sığınağa iner. Ayaklarını yere koyarak, balina çığlıkları ile filmi dinliyor. Su bir çeşmeyi yener: bir itfaiye aracı tarafından atıldı, temelin altına sızdı ve yerde bir delik bulunan yerde tıkandı. Rögar kapağı yükselir, çekimler duyulur. Isana geri çekiliyor. Su yükselir ve yükselir. Ağaçların ve balinaların ruhlarına dönersek, Isana onlara son affediciliği gönderir ve ölür.