Ivan Petrovich Shuisky'nin evinde, birçok din adamının ve bazı boyarların varlığında, Fyodor Ioannovich'i Godunova'nın kız kardeşi tsarina ile boşanmaya karar veriyorlar, bu sayede Boris her halükarda tutulur. Kraliçenin kısırlığını ve Demetrius'un bebekliğini hatırlayarak, kraldan yeni bir evliliğe girmesini istedikleri bir kağıt hazırlarlar. Golovin, Shuisky'ye Demetrius'u Fedor'un yerine koyma olasılığı hakkında ipuçları verir, ancak sert bir geri ödeme alır. Princess Mstislavskaya misafirleri yanınızda taşıyor, Fedor'un sağlığını içiyor. Mstislavskaya'nın damat Shakhovsky, çöpçatan Volokhov gizli toplantının yerini çağırıyor. Ivan Petrovich, Büyükşehir'e kraliçeyi yok etme ihtiyacını karşılayan bir dilekçe gönderir. Uşak Fedyuk Starkov, Godunov'un gördüklerini rapor ediyor. Uglich'ten Golovin’in Nagimi ile ilişkisi hakkında bilgi alan ve gücüne yönelik bir tehdit gören Shuisky ile uzlaşma kararını destekçileri Lup-Kleshnin ve Prens Turenin’e duyurdu. Fyodor geldi, bükülmüş bir attan şikayetçi. Fedor, kilisede gördüğü güzellik Mstislavskaya hakkında yaramaz bir şekilde rapor veren Kraliçe Irina görünür ve kraliçeye onun için herkesten daha güzel olduğunu hemen garanti eder. Godunov, Shuisky ile anlaşmaya varma arzusundan bahseder ve çar konuyu memnuniyetle ele alır.
Fedor, Godunov'u Shuisky ile uzlaştırma niyetini açıkladı ve Büyükşehir Dionysius ve diğer din adamlarından yardım istedi. Dionysius, Godunov'u kiliseye baskı yapmak, sapkınlığa yatkın olmak ve kilisenin serbest bırakıldığı vergi tahsilatını sürdürmekle suçlar. Godunov ona koruyucu mektuplar sunar ve yapılan sapkınlıklara karşı zulüm hakkında raporlar verir. Kral Irina ve boyarlardan destek istiyor. Popüler coşku eşliğinde Ivan Petrovich Shuisky geliyor. Fedor, Duma'yı ziyaret etmediği için onu suçluyor, Shuisky, Godunov'a rıza göstermenin imkansızlığı nedeniyle cesaretini kırıyor. Kutsal Yazıları hatırlayıp tanıklar için din adamlarını çağıran Fyodor, uzlaşmanın faydalarından bahsediyor ve ona itaat eden Godunov, Shuisky rızası sunuyor. Shuisky, John'un beş boyarlığa sahip olduğu devlet yönetimini paylaşmak istemediği için onu suçluyor: Zakharyin (merhum), Mstislavsky (zorla tonlanmış), Belsky (sürgün edilmiş), Godunov ve Shuisky. Godunov, kendisini haklı çıkararak, Shuisky’nin kibirinden bahsetti ve tek gücü Rusya'nın yararına kullandı; Sinir bozucu bir durumu düzene sokmanın zor görevinin sadece Shuysky olduğunu ekliyor. Ve Ivan Petrovich destekçisi Metropolitan'ı çağırdığında, Godunov’un kilise lehine yaptığı eylemler hakkında rapor veriyor ve Shuisky'yi barışa ikna ediyor. Pskov tapınağı için işlemeli kapağını gösteren Irina, bunun bir zamanlar Pskov'daki Litvanyalılar tarafından kuşatılan Shuisky'nin kurtuluşu için dua sözü olduğunu itiraf ediyor. Heyecanlı bir Shuisky eski düşmanlığı unutmaya hazır, ancak Godunov güvenlik garantilerinden ortaklarına talepler. Godunov küfreder ve çarmıhını öper. Seçilenleri Shuisky'nin getirdiği kalabalıktan davet ediyorlar. Fyodor yaşlı adamla konuşuyor ve onu nasıl durduracağını bilmiyor, yeğeninde, son zamanlarda bir ayı dövüşüyle eğlendiren tüccar Krasilnikov'u tanıdı, Shakhovsky'yi yumruklarla yenen kardeşi Golub'u geri çağırmayı başaramadı. . Shuisky Godunov ile uzlaştığını duyurdu, tüccarlar endişeli (“Başımızı uzlaştırıyorsunuz”), Shuisky çarmıhta yemin eden kişiye olan güvensizliğinden rahatsız. Tüccarlar kral Godunov'dan korunmalarını ister, ancak onları Boris'e gönderir. Boris sessizce tüccarların isimlerini yazmayı emreder.
Geceleri Shuisky Prensesi Mstislavskaya ve Vasilisa Volokhova'nın bahçesinde Shakhovsky'yi bekleyin. Geliyor, aşktan, düğünün beklediği sabırsızlıktan bahsediyor, ona gülüyor ve onunla şaka yapıyor. Krasilnikov içeri giriyor, içeri giriyor, Shakhovsky saklanıyor, Ivan Petrovich'i çağırıyor ve çar olan herkesin Godunov'un emriyle yakalandığını bildiriyor. Şok Shuisky Moskova'ya Godunov'a yükselmesini emreder. Dimitri Golovin'e aniden ayrıldığını ima etti ve Boris'in kendini aldattığını söylediğini söyleyerek çar'a gitti. Bu arada kalan boyarlar yeni bir kraliçe aramak için dilekçeyi tartışıyorlar. Vasily Shuisky, Prenses Mstislavskaya'yı arar. Kardeşi hemen karar vermedi, en azından Shakhovsky ile kavga etmek için bir neden bulmak istedi. Tereddüt ederken, Golovin prensesin adını bir dilekçeye yazar. Shakhovskaya, gelini bırakmayacağını ilan ederek ortaya çıkar. Prenses ve Volohova da bulunur. Genel bir ağlama, karşılıklı tehditler ve kınamalar ile Shakhovskaya bir mektup alır ve kaçar. Godunov, içeriği girmediği ancak Boris’in kararlarını kabul ettiği çar devlet belgelerine sunar. Tsarina Irina, Dimitri ile Moskova'ya dönme isteği ile Dowager Kraliçesi'nden Uglich'ten bir mektuptan bahsediyor. Fyodor davayı Boris'e emanet ediyordu, ancak Irina ondan "aile meselesi" nin çözümünü istedi; Fedor Boris ile tartışır ve aziminden rahatsız olur. Shuisky gelir, Godunov'dan şikayet eder. Tüccarların geçmişe götürülmediğini, onunla Shuisky arasındaki dünyayı üzmeye çalıştıklarını açıklayarak kilidini açmaz. Çar, Godunov'u affetmeye hazır, sadece birbirlerini anlamadıklarına inanıyor, ancak prensi Uglich'te terk etme konusundaki acımasız talep sonunda çar'a kızıyor. Godunov, Shuisky'ye yol verdiğini söylüyor, Fedor ona kalmanın yalvarması için yalvarıyor yalvarır, Shuisky, çar'ın davranışından yaralanır. Kleshnin, Golovin Nagim’in Uglich'ten gönderdiği mektubu getiriyor, Godunov bunu Shareky'nin gözaltına alınmasını ve muhtemelen idam edilmesini talep ederek çarlığa gösteriyor. Arıza durumunda ayrılmakla tehdit eder. Uzun süren tereddütten sonra Şok Fedor Godunov'un hizmetlerini reddediyor.
Ivan Petrovich Shuisky, Prenses Mstislavskaya konsolunu: Çar'la evlenmesine izin vermeyecek ve Shakhovskaya'nın onları bilgilendirmeyeceğini umuyor. Prensese göndererek, boyarları ve kaçakları Krasilnikov ve Dove'yi kabul eder ve fakir Fedor'un kaldırılması ve Demetrius'un taçlandırılmasını varsayarsak, herkesin görevlerini tanımlar. Evde oturan yabancı Godunov, Kleshnin'e Volohova hakkında sorar ve “prense fahişe eder” diye defalarca tekrarlar. Kleshnin Volokhov'u UGLICH'ye yeni bir anne gönderir, korunmasını emreder ve çeltikten muzdarip prens kendini öldürürse, ona sormayacaklarını ima eder. Bu arada Fedor, kendisine sunulan belgeleri anlayamaz. Kleshnin gelir ve Boris'in hayal kırıklığına uğradığını ve Shuisky'nin Demetrius'u tahta çıkarmaya niyetli olduğu için derhal hapsedilmesi gerektiğini bildirir. Fedor inanmıyor. Shuisky, Fedor'un bir ihbardan bahsettiği ve ondan kendini haklı çıkarmasını istediği yere girer. Prens reddediyor, kral ısrar ediyor, Kleshnin itiyor. Shuisky isyanı itiraf eder. Godunov'un ihanetten dolayı Shuisky'yi cezalandıracağından korkan Fyodor, prens'i tahtın üzerine koymayı emrettiğini açıkladı ve şok Shuisky'yi odadan zorladı. Shakhovskaya kraliyet odalarına girer ve gelini ona geri göndermeyi ister. Ivan Petrovich Shuisky'nin imzasını gören Fedor, Irina'nın gazetenin saçmalık hakkındaki argümanlarını ağlıyor ve dinlemiyor. Irina'yı hakaretlerden koruyarak, Borisov’un emrini imzaladı, hem onu hem de Shakhovsky'yi korkuttu. Nehrin üzerindeki köprüde yaşlı adam Shuisky için insanları isyan eder, hafif süvari cesareti hakkında şarkı söyler. Bir haberci, Tatarların ilerleyişi haberiyle birlikte gider. Okçularla Prens Turenin Shuisky'yi hapse götürür. Yaşlı adam tarafından sürülen insanlar, Shuisky'yi serbest bırakmak istiyorlar, ancak "kutsal" kralın önünde suçundan ve cezalandırılmayı hak ettiklerinden bahsediyor.
Kleshnin Godunov'a Shuiskys ve destekçilerinin hapsedildiğini bildirir ve Vasily Ivanovich Shuisky'yi tanıtır. Meseleyi Godunov'un iyiliği için bir dilekçe başlatmış gibi çevirir. Shuisky'nin elinde olduğunu anlayan Godunov, gitmesine izin verir. Tsarina Irina, Ivan Petrovich'e müdahale etmeye geliyor. Shuisky'nin onunla tartışmayı bırakmayacağını fark eden Godunov kararlı. Katedralin önündeki meydanda dilenciler, büyükşehirde Godunov'a karşı sakıncalı bir değişiklikten, Shuisky'nin arkasında duran tüccarların infazından bahsediyorlar. Tsarina Irina, Mstislavskaya'yı Shuisky'yi istemeye yönlendirir. Fedor, Tsar Ivan için bir görev yapmış olan katedralden çıkar. Prenses ayağa kalktı. Fedor, Prens Turenin'i Shuisky'ye gönderdi. Ancak Turenin, Shuisky'nin geceleri kendini boğduğunu, göz ardı ettiği için kendini suçladığını bildirdi (çünkü Shakhovsky'nin hapishaneye getirdiği kalabalığı yendi ve sadece Shakhovsky'yi vurarak dövdü). Fedor, Turenin'e koşarak Shuisky'yi öldürmekle suçlar ve infaz ile tehdit eder. Haberci, Uglich'ten prensin ölümü hakkında bir mektup getiriyor. Şok kral gerçeğin kendisini bulmak istiyor. Han'ın yaklaşımı ve Moskova'nın erken kuşatması hakkında bir mesaj geliyor. Godunov, Kleshnin ve Vasily Shuisky'yi göndermeyi teklif ediyor ve Fedor, Godunov'un masumiyetinden emindir. Prenses Mstislavskaya saçlarını kestirmek istediğini söyledi. Fedor, eşinin tavsiyesi üzerine, hükümetin tüm yükünü Boris'e devredecek ve “her şeye katılıyorum, her şeyi düzeltecek” niyetini hatırlayarak kaderini ve kraliyet görevini değiştiriyor.